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Bioinformatik

Sommer

(engl. Bioinformatics )

Modulnummer: FIN-INF-700003
Link zum LSF: LSF
Verantwortung: Andreas Nürnberger
Dozent:in: Andreas Nürnberger
Lehrveranstaltungen:
  • Vorlesung Bioinformatik
  • Übung Bioinformatik
Verwendbarkeit: - B.Sc. INF: Informatik - Wahlpflicht
- B.Sc. CV: Informatik - Wahlpflicht
- B.Sc. INGINF: Informatik - Wahlpflicht
- B.Sc. WIF: Gestalten und Anwenden - Wahlpflicht
- B.Sc. INF (bilingual): Informatik - Wahlpflicht

Kürzel

BioInf

CP

5

Semester

Sommer

Fachsem.

ab 5.

Dauer

1 Semester

Sprache

deutsch

Niveau

Bachelor

Angestrebte Lernergebnisse:
Die Studierenden ...

  • verstehen verschiedene Datenstrukturen für Bioinformatik
  • können Basisalgorithmen zur Bearbeitung von Sequenzdaten anwenden und programmieren
  • wenden Clusteranalyse und verschiedene Heuristiken für die Bearbeitung molekularbiologischer Daten an

Inhalt:

  • Einführung in die Bioinformatik und die Molekularbiologie
  • Einführung in Datenbanken und speziell molekularbiologische Datenbanken
  • Algorithmen zur Sequenzanalyse
  • Heuristische Methoden für die Sequenzanalyse
  • Algorithmen zur Clusteranalyse
  • Expressionsdatenanalyse
  • Algorithmen zum Aufbau phylogenetischer Bäume

Arbeitsaufwand:
56h Präsenzzeit + 94h selbstständige Arbeit

Prüfungsvorleistungen: Studien-/Prüfungsleistungen: Lehrform / SWS:

Klausur. Voraussetzung zur Teilnahme an der Prüfung werden in der ersten Vorlesung und online bekannt gegeben.

  • 2 SWS Vorlesung
  • 2 SWS Übung
Voraussetzungen nach Prüfungsordnung: Empfohlene Voraussetzungen:

keine

Algorithmen und Datenstrukturen

Medienformen: Literatur:


  • R. Merkl. Bioinformatik: Grundlagen, Algorithmen, Anwendungen (4. Auflage), Wiley-VCH, 2022.
  • R. Merkl, S. Waak. Bioinformatik Interaktiv: Algorithmen und Praxis. Wiley-VCH, 2003.
  • R. Rauhut. Bioinformatik: Sequenz-Struktur-Funktion. WileyVHC, 2001.
  • D.E. Krane, ML. Raymer. Fundamental Concepts of Bioinformatics. Pearson Education, 2003.
  • J. Setubal, J. Meidanis. Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company, 1997.
  • A. M. Lesk. Bioinformatik: Eine Einführung. Spektrum Akademischer Verlag, 2002.
  • A. M. Lesk. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, 2002.

Hinweise:

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